Для АО "Независимая Нефтегазовая Компания" стратегически важным направлением является развитие собственной научной базы, представленной ООО "СахалинНИПИ нефти и газа", имеющим подразделения в четырех регионах РФ. Институт основан в 1948 году и является одним из старейших в России.
За последние годы было проведено полное переформатирование деятельности института. Открыты филиалы в трех регионах, открываются новые ранее не представленные направления, формируется штат высокопрофессиональных специалистов, внедряются современные инструменты выполнения и контроля работ.

Постоянная работа над повышением квалификации сотрудников и качества результатов деятельности позволяет выполнять своими силами наукоемкие задачи, особо актуальные с учетом роста доли добычи трудноизвлекаемых запасов в РФ. В несколько раз выросло число сотрудников, имеющих аккредитацию в Евразийском союзе экспертов по недропользованию - ключевой отраслевой организации, признаваемой на государственном уровне, а также за пределами РФ. Повышается число сотрудников, обладающих учеными степенями.
Реализация стратегии развития института позволяет обеспечивать выполнение собственными силами полного спектра задач сопровождения геологоразведочной деятельности и лицензирования, а также выполнения всех научно-исследовательских и проектных работ, необходимых для осуществления производственной деятельности компаний Группы ННК.